Хоть тема и старая, но вопрос этот периодически возникает. Действительно, куда удобнее прописывать тип отображения материалов сразу в .qc и не париться каждый раз с галочками в model viewer'е.
Здесь можете скачать улучшенный studiomdl.exe, понимающий $texrendermode:
http://www.hlfx.ru/forum/showthread.php?threadid=2615
Закинуть в папку GUI StudioMDL.