Есть. Я бы даже сказал, что поверх окна рисовать проще, чем через видеохук. Правда, такое рисование происходит примерео 30 раз в секунду и соответственно противно мерцает. Зато если сделаешь скриншот (или Стим сделает автоматом), то на скриншот будет честнее, чем слеза младенца.
Вот, я рисовал поверх окна. При чём, на видео, записанно с фрапса ничего не было. В двнном случае записывалось через BandiCam.
Однако, большинство читов рисует либо стандартными функциями движка, либо внедряет картинку в видеопоток. Там уже всё будет видно, зато читеру играть приятно.