Попозже попробую посмотреть карту, но могу предположить, что поезд едет и в это время ты перезапускаешь игру, а поезд будет все также двигаться, игнорирую рестарт, там и пути наверное могут сбиться.

Оффтоп

но func_wall кушает брашевые энтити, иногда, хорошо и вовсе не превращать не в то и не в другое, чтобы листья создавались помельче)